北大涉及经济学的有四个单位，经济学院，中国经济研究中心（现在叫国家发展研究院），光华管理学院，汇丰商学院（在深圳）。另外北大的区域经济学在其政府管理学院。经济学院偏向于传统经济学，中国经济研究中心更加西化一些，差不多算现在中国最好的经济学研究、教学机构。

北京大学经济学院简介

北京大学经济学院及其前身北大经济系，综合大学中最早建立的经济系科，是西方经济学和马克思主义经济学在中国最早的传播基地，是北京大学创建的第一个学院，是全国最早设立经济学博士后流动站的学院，是全国文科率先实行硕博连读制的学院，是全国首次获得过“全国文科优秀博士论文”称号的学院 ，是国家教育部“全国经济学人才培养基地”评比唯一连续两次排名第一的学院，拥有全校目前经济类唯一被批准的创新实验区项目《国家教育部“人才培养模式创新实验区”项目》，是北大文科获各种社科基金课题立项最多的院系之一，是北大率先进行教学改革的院系之一，是北大第一个实行硕士研究生两年制的学院，是北大招收各省高考状元最多的院系之一，是北大学生社团最为活跃的院系之一。

北京大学中国经济研究中心简介

北京大学中国经济研究中心（China Center for Economic Research, CCER)）创办于1994年8月，2004年当选为“教育部人文社会科学百所重点基地”。中心的建立是北京大学进行教学和科研体制改革的一种新探索，也是吸引海外留学人员回国服务的一种开创性尝试。北京大学国家发展研究院是在北京大学中国经济研究中心基础上新组建的科研教学机构，通过这一个开放的、跨学科的、多专业视角的平台，完成更高水平的综合性知识集结。北京大学中国经济研究中心将作为国家发展研究院的一个机构继续存在。

没有大太区别,只不过一个项目两家都在做,两家都有这类导师,又不想合做,所以各自开张.光华偏应用,经济学院偏数学和理论研究,一个挂在应用经济学下,一个挂在工商管理下.将来一个授经济学硕士,另一个授管理学硕士,看你更喜欢那个硕士了.