哈尔滨工程大学共有3个国家级重点学科，7个国防重点学科，28个省部级重点学科，依次如下：

国家级重点学科：导航 制导与控制 船舶与海洋结构物设计制造 水声工程

国防重点学科：

固体力学 导航 制导与控制 船舶与海洋结构物设计制造 轮机工程 水声工程 核能科学与工程

辐射防护与环境保护

省部级重点学科：

水声工程 海洋空间运载器系统技术 自动化科学、船舶动力工程 力学 机械工程

信息与通信工程 控制科学与工程 船舶与海洋工程 声学 航空宇航推进理论与工程 计算机软件与理论 检测技术与理论 电力电子与电力工程 模式识别与智能系统 动力机械及工程 材料学 应用化学 信号与信息处理 核能科学与工程 产业经济学

思想政治教育 精密仪器及机械 计算机应用技术? 管理科学与工程 热能工程 光学工程

生物医学工程

下面简单介绍本校的几门热门重点专业：

1.?船舶与海洋工程

培养船舶与海洋结构物总体设计、制造、管理和科学研究方面的高级工程技术人才。

迄今为止，该专业已为我国船舶工业培养本科生近6000人；培养博士、硕士研究生近800人。该专业具有世界先进水平的实验设备和测试手段。主要大型实验室有船模试验水池、水平循环水槽实验室、结构平台实验室、船舶振动与噪声实验室和船舶CAD实验室及为广船国际等大型造船企业设立的tribon软件培训中心等。该院的“船舶与海洋工程”是国内高校首家通过英国皇家造船师协会（RINA）的评估和认证的本科专业，标志着该专业的教学和实验水平得到国际认同。挪威DNV船级社、法国BV船级社、日本NK船级社等国际主要的船级社和英国皇家造船师协会（RINA）在该专业设立奖学金。

2.?热能与动力工程

培养具备机械原理和轮机系统等方面知识，能在船舶建造、船舶动力装置设计和海洋运输等领域从事船舶动力装置设计、轮机操纵、维修和船舶监造等工作，并基本具备同类船舶二管轮任职资格的高级工程技术人才。