厦门大学化学化工学院于1991年在化学系的基础上建立。张乾二院士、万惠霖院士、黄培强教授、江云宝教授曾先后担任学院院长。现任院长为谢兆雄教授。

学院现设化学系、化学工程与生物工程系、化学生物学系共3个系。学院现有能源材料化学协同创新中心、固体表面物理化学国家重点实验室、醇醚酯化工清洁生产国家工程实验室、新能源汽车动力电源技术国家地方联合工程实验室、纳米材料制备技术国家地方联合工程研究中心等5个国家级平台；谱学分析与仪器教育部重点实验室、电化学技术教育部工程研究中心、福建省化学生物学重点实验室、福建省理论与计算化学重点实验室、福建省纳米制备技术工程研究中心、福建省电化学工程技术研究中心、福建省新能源汽车动力电池及储能关键材料工程实验室、福建省高校化石能源化学与化工重点实验室、福建省高校无机化学与功能材料重点实验室、福建省电镀及表面处理行业技术开发基地、福建省精细化工行业技术开发基地、厦门市分子纳米技术与分析科学重点实验室、厦门市合成生物技术重点实验室等科研机构，以及全国高等学校教学指导委员会化学类专业分委会、中国化学会《电化学》编辑部、中国空间学会生命起源与进化专业委员会、福建省化学会挂靠于学院。

学院现有化学、能源化学、化学生物学、化学工程与工艺和生物工程5个本科专业，拥有首批“国家理科基础科学研究和教学人才培养基地”、首批“国家级实验教学示范中心”、首批“国家级教学团队”，入选国家“基础学科拔尖学生培养试验计划”，是教育部“卓越工程师教育培养计划”实施学校，科技部“创新人才培养示范基地”。

学院现辖化学系、化学工程与生物工程系和化学生物学系，所辖材料科学与工程系于2007年发展为材料学院。固体表面物理化学国家重点实验室、醇醚酯化工清洁生产国家工程实验室、电化学技术教育部工程研究中心、福建省化学生物学重点实验室、福建省理论与计算化学重点实验室、福建省纳米制备技术工程研究中心、厦门市分子纳米技术与分析科学重点实验室等科研机构，以及全国高等学校教学指导委员会化学类专业分委会、中国化学会《电化学》编辑部、中国空间学会生命起源与进化专业委员会、福建省化学会挂靠于学院。