软件学院完全隶属于南京大学，而不是像金陵学院那样是南京大学的独立学院，毕业证书与学位证书都是南京大学颁发的。

学费贵是因为国家有关部门给各个学校软件学院的特殊政策，他们可以多收学费，因为教育模式和其它学院不一样。