两个都挺好的，但是偏重不一样。感觉南航比较偏于航空航天方面的自动化技术，有自动化、电气工程与自动化、测控技术与仪器、生物医学工程、探测制导与控制技术5个本科专业。电气工程与自动化、探测制导与控制技术为“十一五”国防特色重点专业。而西工大自动化学院组建不久，有自动化、电气工程及其自动化、信息工程、信息对抗技术、测控技术与仪器等5个本科专业，也涵盖了国防、航空航天等自动化。

不管哪个，以后出来肯定都很好就业。关键是看你喜欢去哪个城市读大学；还有，在大学期间自己要努力用功，多学点东西，而不是像现在大多大学生那样得过且过，这点才是最重要的。其他问题觉得到是其次。

本人南航电气学生，比楼主低一级。

（我是认真的）建议楼主不要考南航电气，今年南航电气研究生招的大部分都是本校的。第二，南航不是歧视二本的学校，但是三院电气自动化的门槛极高，390+的在考研生中算是很普通的。另外，南航的电气教授也不太接受外来生，举个例子，某电气教授，他的亲侄子以前是一普通一本学生，考了两年都没能进南航电气，至于我怎么知道这件事，因为我就是他老乡。

所以我建议楼主不要拿自己的前途开玩笑。

虽然南航电气门槛高，但是三院一专业自动化也不错的，你可以考虑考自动化，那边的师资也很强，关键是没电气那么挤。