学院现有管理科学与工程、工商管理两个管理学门类的一级学科，管理科学与工程一级学科下设管理科学、工业工程、信息管理与电子商务，工商管理一级学科下设企业管理、技术经济、会计学等专业研究方向，均可硕博连读，按照西安交通大学“2+4+X”人才培养模式培养。

上述研究方向除招收管理类有关专业的大学毕业生外，拟有计划地招收理工科有关专业，特别是辅修过企业管理专业的大学毕业生，或与有关专业教师联合招收硕士生，以促进管理学科在交叉和边缘性方面的发展。 2004年，经国家教育部和国务院学位办批准，美国德克萨斯大学与西安交通大学合作，在中国实施EMBA学位合作办学项目，使中国优秀在职人员有机会获得经美国最高商学院评定机构AACSB认证的美国德克萨斯大学阿灵顿商学院的EMBA学位。

本项目共12门课程，教学方式为美方承担9门课，英文授课，西安交通大学老师承担3门课，中文授课。中美合作EMBA项目在设置上体现系统化、国际化、实用性和高质量。着重于国际商务的最新动态，,课程设置在充分利用案例教学体现美国商学院的主流的同时，力求贴近中国当前热点，旨在确保学员能将所学及时高效地应用于实际管理工作中。 会计硕士（Master of Professional Accounting，简称MPAcc）是经教育部、国务院学位办批准设立的一种专业学位；是培养具有良好职业道德，系统掌握现代会计理论与实务以及相关领域的知识与技能，具有会计工作的领导潜质的高素质会计人才。

西安交通大学是经教育部、国务院学位办批准的首批招收培养会计硕士的学校之一。MPAcc培养采取非全日制（即半脱产和在职学习）方式。学制为三年。课程学习采取学分制；教学采取启发和研讨式的教学方式；专业课采取理论与案例相结合的方式教学。学生修满规定学分，成绩合格，并通过学位论文答辩，将授予会计硕士学位。 工程硕士是为社会培养所需要的应用型、复合型、高层次工程技术管理人员的一种专业学位。目前我院工程硕士有三个领域方向：工业工程、项目管理、物流管理。

工业工程专业工程硕士是培养社会需要的适应在各类经济与非经济组织中从事技术或管理工作，及对各类生产系统进行规划、设计、评价、运行、控制和创新等工作的应用型、复合型、高层次的工程技术管理人员。

物流管理工程硕士是培养系统掌握现代物流理论和相关专业知识，具备现代物流专业技能，可以从事物流产业政策与现代物流理论研究，并在物流管理领域从事全过程策划与管理和物流信息化工作的高级复合型管理人才。

项目管理工程硕士是培养具备扎实的理工基础，系统掌握工程管理中所涉及的方法和技术，能够综合运用自然科学、社会科学和现代管理科学与方法对由人员、物料、设备、能源和信息所组成的系统进行设计、评价、改善等项目管理和创新的高级复合型管理人才。

工程硕士采取在职的方式进行培养。课程学习实行学分制，学制为3年。课程考试成绩合格，学位论文答辩通过者，可授予工程硕士学位。 工程管理硕士（Master of Engineering Management，简称MEM）是2010年起国务院学位办新设置的一种专业学位。其目的是适应我国现代工程事业发展对工程管理人才的迫切需求，完善工程管理人才培养体系，创新工程管理人才培养模式，提高我国工程管理的人才质量。

其方向有两个，能源化工工程管理与信息科技工程管理，学制为两-------三年，课程学习采用学分制，课程考试成绩合格，学位论文答辩通过，其他符合要求者可以授予工程管理硕士学位与学历。