南京医科大学好，下面从多角度进行二者的分析对比：

一、师资力量

1、苏州大学：全校现有教职工5254人，专任教师3464人，其中包括1位诺贝尔奖获得者，8位两院院士，7位发达国家院士，30位国家杰出青年基金获得者，41位国家优秀青年基金获得者，1位“万人计划”杰出人才。

2、南京医科大学：有教授218人、副教授280人，有博士生导师752人、硕士生导师2312人。学校现有中国工程院院士2名，美国国家医学院外籍院士1名，国家“万人计划”百千万工程领军人才1人，国家“万人计划”科技创新领军人才3人，国家“万人计划”青年拔尖人才2人，国家百千万人才工程7人，国家杰出青年科学基金获得者9人。

二、学科建设

1、苏州大学：苏州大学共设有132个本科专业；49个一级学科硕士学位授权点，33个专业学位硕士点；28个一级学科博士学位授权点，1个专业学位博士点，30个博士后科研流动站；5个国家重点学科，1个省级重点学科，20个江苏高校优势学科，12个省级一级学科重点学科（含2个培育学科），5个江苏省重点序列学科，15个“十三五”江苏省一级学科重点学科。

2、南京医科大学：学校有一级学科博士学位授权点8个（生物学、基础医学、临床医学、口腔医学、公共卫生与预防医学、药学、医学技术、护理学）、二级学科博士学位授权点54个、3个交叉学科博士学位授权点（临床医学工程、人文医学、健康政策管理）；一级学科硕士学位授权点12个、二级学科硕士学位授权点67个。

三、院系专业

1、苏州大学：医学部下设基础医学与生物科学学院、放射医学与防护学院、公共卫生学院、药学院、护理学院、第一临床学院、第二临床学院、儿科临床医学院、第三临床学院。

2、南京医科大学：五年制预防医学、五年制医学影像学、五年制临床医学、五年制临床医学（儿科医学）、五年制临床药学、五年制口腔医学、五年制基础医学、四年制应用统计学（生物统计学）、四年制英语、四年制医学检验技术、四年制药学。

以上内容参考 百度百科——苏州大学

以上内容参考 百度百科——南京医科大学