长江流域的湖泊按成因可分为多种类型：

①构造湖（断陷湖）。园地壳构造运动产生凹陷而形成的。

②堰塞湖。因地震、山崩河道被阻塞而形成的，如四川岷江上游的大小海子、凉山彝族自治州雷波县境内的马湖等。

③冰川湖。因冰川磨蚀和冰碛物堆积作用，产生洼地积水而形成的，如江源冰川附近的湖泊

④岩溶湖。因地表水和地下水对石灰岩等可溶性岩石的溶蚀作用而形成的，如贵州威宁的草海。

⑤牛轭湖。因平原河流弯曲、改道、裁弯取直，泥沙淤塞了原有河道进出口而形成牛轭状弯曲的湖泊，如荆江两岸的许多湖泊。

⑥泄湖。因河口海岸泥沙沉积，沙嘴和沙洲延展，使浅水海湾与海洋隔离而成湖泊，如杭州西湖。

其它分类方式：

按湖泊和河流的关系，可把长江流域的湖泊分为吞吐湖和非吞吐湖两类。吞吐湖既能蓄纳江水，又可以把湖水排人江河，对江河水量起着天然的调蓄作用，如洞庭湖和鄱阳湖。非吞吐湖又有两种，一种是以湖水流人江河为主，另一种是河水注入洼地形成内湖，不通江河。前者多位于江河源头，成为江河的补给水源；后者多位于长江中下游地区，由于泥沙淤积，人为围垦或有闸坝控制而与长江隔绝。

按湖泊矿化度的大小，湖泊又有淡水湖、咸水湖和盐湖之分。淡水湖的湖水矿化度小于1克／升，长江流域大部分湖泊均属此类。咸水湖的湖水矿化度为1～35克／升，这类湖泊集中于江源地区。咸水湖再进一步蒸发、浓缩，湖面收缩、盐分集中，又演变为盐湖。