南通二本院校有南通大学、南通理工学院、南通大学杏林学院。

1、南通大学：

南通大学Q,简称"通大”, 是江苏省人民政府和国家交通运输部共建的综合性大学,江苏省十五所重点建设大学成员，教育部“卓越医生教育培养计划”、“ 卓越教师培养计划”试点高校。

学校的办学历史可追溯到近代实业家、教育家张謇先生于1912年创办的私立南通医学专门学校和南通纺织专门学校。学校是具有硕士学位授予权的单位。

2、南通理工学院：

南通理工学院简称通理工，学院坐落 于中国首批14个对外开放沿海城市一南通市 ,是经国家教育部、江苏省人民政府、江苏省教育厅批准独立设置的具有颁发高等教育学历文凭资格的全日制民办普通本科高校,也是南通市第一所民办高校。

学院定位在高等职业技术教育，立足南通,服务全省,面向长三角,辐射全国,旨在培养教育、生产、经营、管理第一线的实用型复合型人才。学校毕业生深受社会欢迎, 近三年毕业生的毕业生年终就业率平均为98.22%。

3、南通大学杏林学院：

南通大学杏林学院是经国家教育部批准设置的独立学院, 坐落于风景秀丽素有“江海门户”之称的沿海开放城市、著名的教育之乡一-江苏省南通市 ,以南通大学钟秀校区和启东校区作为办学校园,占地面积419.3亩。

杏林学院依托南通大学实力雄厚的师资队伍，共享母体优质的教育教学资源，专任教师中有教授159人，副教授518人。

教学科研仪器设备总值3.99亿元,图书馆藏书192万册，中外期刊数千种，配有中英文光盘检索系统，设有“中国国家知识基础设施工程”( CNKI )知识网络一级管理服务中心。